Utzon Fonden blev stiftet i 2006 i forbindelse med opførelsen af Utzon Center.
Fonden varetager to hovedaktiviteter: Utzon Center og Can Lis, og alle henvendelser om Jørn Utzons virke og anvendelse af hans materiale er Fonden uvedkommende.
Can Lis, Jørn Utzons sommerhus på Mallorca, blev erhvervet i 2011 med henblik på at bevare huset og gøre det tilgængeligt for offentligheden. Bestyrelsen i Utzon Fonden er ansvarlig for alle aktiviteter vedr. Can Lis. Der er indgået samarbejde med Statens Kunstfonds arkitekturudvalg om at udvælge modtagere til arbejdsophold.